MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015850	GCCT	2	8	1109676	1109683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_015850	CG	4	8	1109734	1109741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_015850	TGC	2	6	1109761	1109766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_015850	CG	3	6	1109870	1109875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_015850	TTC	2	6	1109977	1109982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_015850	TCG	2	6	1109993	1109998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_015850	TCGCT	2	10	1110096	1110105	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_015850	CT	3	6	1110104	1110109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_015850	AGC	2	6	1110115	1110120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_015850	CAT	2	6	1110203	1110208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_015850	TCGC	2	8	1110239	1110246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_015850	ATG	2	6	1110304	1110309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_015850	CGC	2	6	1110338	1110343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_015850	TGT	2	6	1110370	1110375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_015850	AAG	2	6	1110384	1110389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_015850	TAT	2	6	1110390	1110395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015850	CTG	2	6	1110407	1110412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_015850	GAG	2	6	1110440	1110445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_015850	GAT	2	6	1110453	1110458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015850	AC	3	6	1110471	1110476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2521	NC_015850	CGC	2	6	1110503	1110508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_015850	CGT	2	6	1110582	1110587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_015850	GGC	2	6	1111705	1111710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_015850	CG	3	6	1116531	1116536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2525	NC_015850	GGCCCC	2	12	1116576	1116587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2527	NC_015850	ACC	3	9	1116662	1116670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2530	NC_015850	TCGCT	2	10	1116753	1116762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2531	NC_015850	TGT	2	6	1116809	1116814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_015850	GT	3	6	1116832	1116837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015850	AAC	2	6	1116927	1116932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2536	NC_015850	GCC	2	6	1117006	1117011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2539	NC_015850	GATC	2	8	1117151	1117158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_015850	GGCGG	2	10	1117192	1117201	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2541	NC_015850	GATC	2	8	1117240	1117247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_015850	GGC	2	6	1117266	1117271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2544	NC_015850	TAT	2	6	1117325	1117330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015850	TGCC	2	8	1117382	1117389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2547	NC_015850	GAG	2	6	1117457	1117462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_015850	GGA	2	6	1117487	1117492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_015850	ATC	2	6	1119148	1119153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_015850	CAA	2	6	1119178	1119183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_015850	ATC	2	6	1119225	1119230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_015850	ATC	2	6	1119235	1119240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_015850	GCA	3	9	1119558	1119566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_015850	CGGT	2	8	1119597	1119604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_015850	GAC	2	6	1119645	1119650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_015850	CTG	2	6	1119720	1119725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_015850	CTT	2	6	1119728	1119733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_015850	CGC	2	6	1119821	1119826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2560	NC_015850	ACCGA	2	10	1119878	1119887	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2561	NC_015850	ACC	3	9	1120214	1120222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2563	NC_015850	A	7	7	1120463	1120469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_015850	ACGA	2	8	1123537	1123544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_015850	GGGT	2	8	1123561	1123568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_015850	CA	3	6	1123596	1123601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2567	NC_015850	CAT	2	6	1123626	1123631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2569	NC_015850	G	6	6	1123662	1123667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_015850	GC	4	8	1123681	1123688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2573	NC_015850	GAG	3	9	1124636	1124644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2592	NC_015850	CGCC	2	8	1128711	1128718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2595	NC_015850	AGCC	2	8	1131243	1131250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2598	NC_015850	AAGCA	2	10	1131311	1131320	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2599	NC_015850	ACAA	2	8	1131347	1131354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2600	NC_015850	GAG	2	6	1132699	1132704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_015850	CCT	2	6	1134325	1134330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_015850	A	7	7	1134390	1134396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_015850	CT	3	6	1134405	1134410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_015850	AAAG	2	8	1135634	1135641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_015850	GC	3	6	1136372	1136377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2613	NC_015850	G	6	6	1137495	1137500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_015850	ATGA	2	8	1137510	1137517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2624	NC_015850	ACAAA	2	10	1141516	1141525	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2625	NC_015850	TTG	2	6	1141557	1141562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2628	NC_015850	T	6	6	1141663	1141668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_015850	TA	3	6	1141671	1141676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2631	NC_015850	GAT	2	6	1141694	1141699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2734	NC_015850	CT	3	6	1164343	1164348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2759	NC_015850	GAT	2	6	1172838	1172843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2891	NC_015850	GAAA	2	8	1217282	1217289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2892	NC_015850	GTC	2	6	1217327	1217332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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